MJM5 HiPer Universal DNA Mini Kit
使用说明书
产品名称 | 单位 | 货号 |
M5 HiPer Universal DNA Mini Kit | 50T | MF033-plus |
【储存条件】
室温储存 12 个月。
【产品简介】
本试剂盒适合于从新鲜或冷冻的动物组织,细胞,血液,细菌等多种样品中提取高纯度总 DNA。本品可纯化获得分子量最大为 50kb
的DNA 片段,纯化过程不需要使用苯酚或氯仿等有毒溶剂,无需乙醇沉淀。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的 DNA 高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上,PCR 和其他酶促反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可得到高纯度 DNA。纯化得到的 DNA 可以直接用于酶切,PCR,Real-Time PCR,文库构建,Southern Blot,分子标记等下游实验。
【自备试剂】
无水乙醇
Enzymatic LysisBuffer(提取革兰氏阳性菌基因组 DNA 时须准备)。
Enzymatic LysisBuffer 配方:20 mM Tris,pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2%Triton X-100;终浓度为20mg/ml 的 Lysozyme(溶菌酶)。
【产品组份】
50T | |
Buffer GTL | 15 ml |
Buffer GL | 15 ml |
Buffer GW1(concentrate) | 13 ml |
Buffer GW2(concentrate) | 15 ml |
Buffer GE | 15 ml |
Proteinase K | 25mg |
Proteinase K Storage Buffer | 1.25 ml |
Spin Columns DM | |
with Collection Tubes | 50 个 |
【实验前准备及重要注意事项】
1. 向 Proteinase K(25mg)中加入指定用量的 Proteinase K Storage Buffer(1.25ml)使其溶解,-20˚C 保存。配制好的 Proteinase K 勿长时间室温放置,避免反复冻融,以免影响其活性。
2. 样品应避免反复冻融,否则会导致提取 DNA 片段较小且提取量下降。
3. 如果提取次生代谢产物大量积累或细胞壁厚的细菌培养物的基因组,建议在对数生长期早期收集样品。
4. 第一次使用前应按试剂瓶标签的说明在BufferGW1和Buffer GW2中加入无水乙醇。
5. 使用前请检查 Buffer GTL 和 Buffer GL 是否出现结晶或沉淀,如有结晶或沉淀,请将 Buffer GL 和 Buffer GTL 于 56˚C 水浴重新
溶解。
6.如果下游实验对 RNA 污染比较敏感,可以在加入 Buffer GL 前加入 4μl DNase-Free 的 RNase A(100mg/ml),RNase A 本试剂盒并未提供,可单独订购。
【操作步骤】
血液及细胞样本基因组提取
1. 材料处理
a) 如果提取材料为哺乳动物抗凝血液(无核红细胞),可直接向50-200μl 新鲜或冷冻的抗凝血液样品中加入 Buffer GTL 补足至200μl。
b) 如果提取材料为禽类,鸟类,两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核细胞,取5-10μl 新鲜或冷冻的抗凝血液样品,加入 Buffer GTL 补足至 200μl。
c) 贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液(最大提取量为5x106个细胞),2000 rpm(400xg)离心5分钟,弃尽上清,加200μl GTL,振荡至样品彻底悬浮。
注意:如需去除 RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl 浓度为100mg/ml 的 RNase A 溶液,涡旋15秒,室温放置2分钟。
2. 加入20μl Proteinase K 溶液(第一次使用按注意事项说明溶解)。
3. 加入200μl Buffer GL,涡旋振荡充分混匀,56˚C水浴10分钟。
4. 短暂离心以去除管盖内壁的水珠。加入200μl 无水乙醇,涡旋振荡充分混匀,短暂离心。
注意:1)加入 Buffer GL 和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)加入 Buffer GL 和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织在加入 BufferGL 和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。
5. 上一个步骤中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm(约13,400xg) 离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高 DNA 纯度,可重复步骤7。
8. 12,000 rpm 离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR 等)。
9. 将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μl Buffer GE 或灭菌水,室温放置2-5分钟,12000rpm 离心1分钟,收集 DNA 溶液,-20˚C 保存 DNA。
注意:1)如果下游实验对 pH 值或 EDTA 敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的 pH 值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其 pH 值在7.0-8.5(可以用 NaOH 将水的 pH 值调到此范围),pH 值低于7.0时洗脱效率不高。
2)Buffer GE 在65-70˚C 水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200 μl BufferGE 或灭菌水再
次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高 DNA 的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟;若洗脱体积小于200 μl,可以增加 DNA 的终浓度,但可能会减少总产量。如果 DNA 的量小于1 μg,推荐用50 μl Buffer GE 或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的 DNA 会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用 Buffer GE 洗脱并于-20˚C 保存。
动物组织基因组提取
1. 材料处理
如果提取材料为动物组织,取25 mg(脾组织用量应少于10mg);如果材料为鼠尾,取一段长度为0.4-0.6 cm 的大鼠鼠尾或两段长度为0.4-0.6 cm 的小鼠鼠尾。
a. 样本进行液氮研磨或切成小块后置于1.5 ml 离心管中,加入180μlBuffer GTL,将不同样品做好标记。
b. 若使用匀浆器处理样本,匀浆前向样本中加入不超过80 μl Buffer GTL,匀浆后加入100 μl Buffer GTL。
注意:1)确保各组织的量不要超出推荐范围。
2)组织样本在加入 Buffer GTL 之前用液氮研磨或加入 Buffer GTL 用匀浆器匀浆处理,可以增加裂解效率。
2. 加入20 μl Proteinase K,涡旋震荡使样品彻底混匀。56˚C水浴,直至组织完全裂解,孵育过程中可每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样品分散。
注意:1)不同组织消化时间不同,通常 1-3 小时即可完成,鼠尾需要消化6-8 小时,必要时过夜消化,不会影响后续操作。
2)如果孵育和涡旋震荡后仍然有胶状物质,延长56˚C 孵育时间或再加入20 μl Proteinase K 消化。
3)如需去除 RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl 的浓度为100mg/ml 的 RNase A 溶液,涡旋15秒,室温放置5-10分钟。
3. 加入200 μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀,70˚C水浴10分钟。短暂离心后加入200 μl 无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。注意:1)加入 Buffer GL 和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)加入 Buffer GL 和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织(如脾,肺)在加入 Buffer GL 和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。
4. 短暂离心,将步骤3所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm(约13,400xg )离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm。离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高 DNA 纯度,可重复步骤6。
7. 12,000 rpm 离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切,PCR 等)。
8. 将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE 或灭菌水,室温放置2-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟,收集 DNA 溶液,-20℃保存 DNA。
注意: 1)如果下游实验对 pH值或 EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的 pH值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其 pH 值在7.0-8.5(可以用 NaOH 将水的 pH 值调到此范围),pH 值低于7.0时洗脱效率不高。
2)Buffer GE 在65-70°C 水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200 μl BufferGE 或灭菌水
再次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高 DNA 的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟;若洗脱体积小于200 μl,可以增加 DNA 的终浓度,但可能会减少总产量。如果DNA的量小于1 μg,推荐用50 μl Buffer
GE 或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的 DNA 会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用 Buffer GE 洗脱并于-20°C 保存。
细菌基因组提取
1. 细菌样本预处理
1a. 革兰氏阴性菌
(1) 取细菌培养物1-5 ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备)中,12,000rpm(~13,400xg)
离心 1 分钟,尽量吸净上清。
(2) 向沉淀中加入180 μl Buffer GTL,振荡使菌体重悬。
(3) 加入20 μl Proteinase K,涡旋混匀,56°C孵育,直至菌体完全裂解,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。
注意:如需去除 RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl 浓度为100 mg/ml 的 RNase A 溶液,震荡混匀,室温放置5-10
分钟。
(4)
加入 200
μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。
1b. 革兰氏阳性菌
(1) 取细菌培养物1-5ml(106-108个细胞,最多不超过2×109个细胞)置于离心管(自备)中,12,000rpm离心 1 分钟,尽量吸净上清。
(2) 加入 180μl Enzymatic Lysis Buffer(自备)使菌体重悬。
(3) 37°C孵育 30 分钟。
(4) 加入 20μl Proteinase K涡旋震荡,充分混匀。加入 200μl Buffer GL,涡旋震荡混匀。56℃孵育 30 分钟。
注意:1)如果需要,95°C 孵育15分钟可以使病原体失活,但是95°C 孵育会造成一些 DNA 的降解。
2)如需去除 RNA,可在上述步骤完成后,加入4 μl 浓度为100 mg/ml 的 RNase A 溶液,震荡混匀,室温放置 5-10 分钟。
2. 加入200 μl 无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。
注意:加入无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。
3. 将步骤2所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入到已装入收集管的吸附柱(SpinColumns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm 离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
4. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5. 向吸附柱中加入500 μl Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
注意:如需进一步提高 DNA 纯度,可重复步骤5。
6. 12,000 rpm 离心2分钟,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR 等)。
7. 将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200 μl Buffer GE 或灭菌水,室温放置2-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟,收集 DNA 溶液,-20°C 保存 DNA。
注意:1)如果下游实验对 pH 值或 EDTA 敏感,可以用灭菌水洗脱。洗脱液的 pH 值对洗脱效率有很大影响,若用水做洗脱液应保证其 pH 值在 7.0-8.5(可以用 NaOH将水的 pH 值调到此范围),pH 值低于 7.0 时洗脱效率不高。
2)Buffer GE 在65-70°C 水浴预热,离心之前室温孵育5分钟可以增加产量;用另外的50-200 μl Buffer GE 或灭菌水
再次洗脱可以增加产量。
3)如果要提高DNA的终浓度,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2-5分钟,12,000 rpm 离心1分钟;若洗脱体积小于200 μl,可以增加 DNA 的终浓度,但可能会减少总产量。如果 DNA 的量小于1 μg,推荐用50 μl Buffer GE 或灭菌水洗脱。
4)因为保存在水中的 DNA 会受到酸性水解作用的影响,如需长期保存,推荐用 Buffer GE 洗脱并于-20℃保存。